Sequence and structure based bioinformatic tools to the characterization, clustering and modeling of G-protein-coupled receptors (GPCRs)

Resumen

En este trabajo, hemos desarrollado nuevas herramientas para el estudio de los receptores acoplados a proteína G (GPCRs). La importancia farmacológica de estos receptores motiva el desarrollo de métodos alternativos para ayudar su clasificación, identificación farmacológica y modelaje por comparación. Basado en los recientes avances in la cristalización de GPCRs, una nueva estrategia ha sido propuesta para un alineamiento múltiple de secuencias que incorpora irregularidades estructurales observadas en las estructuras de los receptores. El desarrollo de un alineamiento de secuencias basado en las estructuras fue usado para actualizar la clasificación de GPCRs con significativos avances comparado con estudios previos. Los recientes datos estructurales fueron también usados para mejorar el análisis de las similitudes de lugares de unión ortostérico. En especial, como parte de esta tesis, hemos desarrollado una novedosa matriz de substitución derivado específicamente de las GPCRs (GPCRtm) y la aplicación web (GPCR-Browser) que permite una comparación mas fácil de las secuencias de receptors entre subfamilias.

Fecha de lectura	15 sept 2017
Idioma original	Indefinido/desconocido
Institución de lectura	Hospital de la Santa Creu i Sant Pau
Supervisor	Mireia Duñach Masjuan (Tutor/a), Gianluigi Caltabiano (Director/a) & Angel Gonzalez Wong (Director/a)