Interactómica, análisis estructural y búsqueda de fármacos: Aplicaciones a sistemas proteolíticos y a modelos amiloidogénicos

En este proyecto pretendemos seguir desarrollando herramientas de proteómica experimental y computacional para la identificación de proteínas y sus ligandos, y también para su caracterización estructural profunda, con el objetivo de poder aplicar algunas de ellas en los estadios iniciales de diseño de fármacos. Los desarrollos y resultados experimentales en los campos de la quimiogenómica y \i molecular imaging\i0 se intentaran aplicar a muestras bilógicas naturales y complejas y también eventualmente, a modelos \i in vivo\i0 . Con el objeto de desarrollar estas aplicaciones seleccionaremos principalmente sistemas proteolíticos - proteasas e inhibidores-, y en particular los relacionados con metalocarboxipeptidasas, en los que nuestros grupos tienen una considerable experiencia, así como modelos amiloidogénicos, ambos con potencialidad biotecnológica y biomédica. En ciertos sistemas, como los relacionados con especies de Plasmodiums y Tripanosomas causantes de la malaria y la enfermedad de Chagas, respectivamente, llevaremos a cabo una amplia caracterización estructural y funcional de las moléculas seleccionadas antes de iniciar el programa de diseño de ligandos y fármacos. En otros casos utilizaremos la experiencia previa, nuestra y de otros grupos, para el desarrollo de fármacos de modo más inmediato, como en los relacionados con desórdenes en la fibrinolisis o dev tipo amiloidogénico. De manera paralela, se utilizaran procedimientos de análisis y cribaje de alto rendimiento en la búsqueda de nuevas moléculas utilizables como compuestos de partida a partir de extractos de determinados organismos vivos (p.e. procedentes de la flora y fauna de América Central y del Sur), con el objeto de complementar el programa de diseño de fármacos y ligandos antes descrito.