Empremta de la selecció, desequilibri de lligament i mapatge ultrafí en l'espècie porcina

Si identificamos una región del genoma que haya sido diana de la selección, esta región debería contener genes de interés económico potencial. El objetivo de este proyecto es poder distinguir si los cambios en frecuencias alélicas entre diversas poblaciones de porcino en cinco genes candidatos son debidas azar, a la selección, o a ambas. Para ello, analizaremos el polimorfismo nucleotídico (SNPs) en cinco regiones del genoma del jabalí y dos poblaciones porcinas: cerdo Ibérico y la raza Duroc. Las regiones a analizar son: IGF2 (cr.2), SLA (cr.7), DECR (cr4), SRY (cr.Y), FACL4 (cr.X). La comparación entre las líneas Ibéricas y el jabalí nos permitirá descubrir algunos de los cambios producidos en la domesticación, mientras que la comparación con Duroc nos informaría sobre el tipo de selección que ha ocurrido en cada una de las regiones analizadas. Este estudio nos permitirá caracterizar, además, una serie de parámetros fundamentales para la cartografía fina de QTL, como son la tasa de mutación y de desequilibrio de ligamento en las distintas regiones. Como complemento al trabajo experimental, también proponemos desarrollar: 1) diversas innovaciones metodológicas para identificar los polimorfismos causales (mapeo ultrafino) y para relacionar los datos de expresión con los polimorfismos de ADN (Genética genómica); y 2) una plataforma bioinformática accesible públicamente vía Web que permita facilitar al máximo la gestión de nuestros datos y extraer automáticamente, a partir de las bases públicas genéticas (GenBank, etc..) la información relevante de polimorfismos en porcino