Ha participado como investigadora principal en 2 proyectos nacionales, y en 1 proyecto europeo (H2020) y como investigadora en 14 proyectos nacionales (financiados principalmente por el Gobierno Español y el Consejo de Seguridad Nuclear) y 6 proyectos internacionales (financiados por The Wellcome Trust, la Agencia Española de Cooperación Internacional o la Unión Europea, entre otros). También ha participado en un convenio de colaboración entre el Consejo de Seguridad Nuclear y la UAB. Pertenece a un grupo de investigación financiado por la Generalitat de Catalunya denominado "Estudios citogenéticos y moleculares sobre el efecto de las radiaciones ionizantes y el cáncer" (2014SGR354). Además, participó en la Red Nacional de Cáncer de España.

Ha publicado 64artículos, todos ellos en revistas científicas internacionales de alto impacto, en 14 de ellos fue primera autora y en 8, autora senior. Tiene otras contribuciones científicas, como tres capítulos de libros y dos artículos de divulgación. En total, tiene 1219 citas y un índice h de 20. Ha sido directora de 4 Ph.D. tesis y 15 tesis de maestría. Ha realizado numerosas estancias en el extranjero, incluyendo en el Departamento de Genética Médica de la Universidad de Helsinki y en la Universidad de Colorado en EE. UU.

Gemma Armengol es profesora en la Universitat Autònoma de Barcelona (UAB, Barcelona, ​​España), donde imparte clases de Genética Humana y Genética del Cáncer. Obtuvo su licenciatura en Biología (1994), su M.Sc. en Antropología Biológica (1996) y Doctor en Biología por la UAB (2000). Durante su tesis doctoral, investigó variaciones en el número de copias de genes en tumores. Posteriormente realizó una estancia postdoctoral durante la cual se dedicó a la caracterización genética de microorganismos y su aplicación biotecnológica. Tras 5 años en el extranjero, obtuvo una beca de dos años de la Generalitat de Cataluña destinada a promover el regreso de los investigadores que trabajan en el extranjero y reanudó la investigación en cáncer. Tras este periodo, trabajó como directora de laboratorio en el Hospital Vall d’Hebron de Barcelona durante un año, realizando investigaciones sobre alteraciones genéticas y bioquímicas de tumores sólidos. En 2007 consiguió un puesto en la UAB como Profesora Titular y tres años más tarde consiguió un puesto fijo en la misma universidad. Actualmente ocupa el cargo de Profesora Titular de Universidad en la UAB.

Ha dirigido 4 tesis doctorales que se listan a continuación:

Título: Estudio de la expresión de RSK4 en tumores humanos y su relación con senescencia

Doctorando: Laura López Vicente

Universidad: Autónoma de Barcelona

Facultad / Escuela: Biociencias

Fecha: 22/01/2010

Título: Estudio de 4E-BP1 y su regulación en cáncer de mama

Doctorando: Berta Pons López

Universidad: Autónoma de Barcelona

Facultad / Escuela: Biociencias

Fecha: 13/07/2010

Título: Estudio de la respuesta a las radiaciones ionizantes de dos líneas celulares con diferente radiosensibilidad

Doctorando: Mireia Borràs Fresneda

Universidad: Autónoma de Barcelona

Facultad / Escuela: Biociencias

Fecha: 02/06/2016

Título: Polimorfismos genéticos y tratamiento antitumoral: evolución de los pacientes con leucemia linfoblástica aguda e inducción de leucemias secundarias

Doctorando: Maria Cabezas Somalo

Universidad: Autónoma de Barcelona

Facultad / Escuela:Biociencias

Fecha: 19/07/2017

Tiene experiencia en la detección de mutaciones (específicamente mutaciones de secuencia y cambios en el número de copias de genes) en células tumorales mediante diferentes metodologías moleculares: hibridación genómica comparativa en metafases y en microarrays, PCR, RT-PCR cuantitativa y secuenciación de próxima generación. En la actualidad investiga sobre variantes genéticas que se relacionan con un mayor riesgo de desarrollar cáncer o con un peor pronóstico tras quimioterapia o radioterapia. Además, recientemente ha estado involucrada en investigaciones sobre radiosensibilidad. Ha evaluado la respuesta transcripcional diferencial tras la irradiación de dos líneas celulares: una radiosensible y otra radiorresistente, mediante secuenciación de ARN.