Functional genomics in fish: towards understanding stress and immune responses at a molecular level

Resum

Aquesta tesis doctoral està basada en estudiar la resposta immunològica dels peixos en models d'estrès i d'activació del sistema immune des la genòmica funcional. L'aplicació de tecnologies moleculars com el Differential Display van permetre identificar y clonar por primera vegada en orades (Sparus aurata) y en altres especies de peix, el gen enolasa. Aquest enzim glucolític s'ha plantejat per primera vegada com un bon marcador molecular per estudiar el benestar dels peixos. Per mitjà de l'ús d'una plataforma de microarrays dissenyada específicament per a salmònids, i altres metodologies biomoleculars, es va comprovar que els nivells d'enolasa eren regulats en diferents teixits y en diferents especies de peix, com també en adverses situacions per l'animal. D'altra banda, s'han estudiat diferents gens immunològics candidats a ser possibles gens per l'estudi del sistema immunològic dels peixos. Aquests gens s'han estudiat a nivell d'expressió en teixits de truites (Oncorhynchus mykiss) mitjançant PCR convencional i PCR quantitativa, i l'ús de metodologies biomoleculars i bioinformàtiques. Entre ells, destaca el factor de transcripció PU.1, un gen indispensable per el desenvolupament de l'hematopoesi. Aquest gen, s'ha clonat i caracteritzat per primera vegada en salmònids. L'expressió de PU.1 s'ha estudiat mitjançant l'ús d'hibridacions in situ en ronyó anterior y en cervell de truita. A més, l'ús de microarray en aquest dos teixits han permès fer un estudi exhaustiu i pioner a nivell de transcriptòmica en peixos. Les anàlisis del xip de microarray, ha revelat que grups de gens s'activen o s'inhibeixen com a conseqüència d'un estrès immunològic. En resum, aquesta tesis doctoral ha aplicat el desenvolupament de noves tecnologies moleculars pioneres en peixos, com el microarray, la clonació de noves seqüències gèniques i la bioinformàtica, per estudiar la genòmica funcional dels peixos en situacions d'activació dels mecanismes d'estrès i del sistema immune.

Data del Ajut	10 de jul. 2006
Idioma original	Anglès
Supervisor	Lluis Tort Bardolet (Director/a) & Simon Anthony Mackenzie (Director/a)