Resum
En aquesta tesi s’ha realitzat un complet i complex estudi computacional de les reaccions catalitzades per dos enzims. El primer mecanisme catalític estudiat correspon a l’enzim β-glicosidasa (família GH1) Thermus thermophillus, en el que s’han analitzat les etapes de glicosidació, hidròlisi i transglicosidació. Posteriorment, s’ha analitzat el procés de transferència de monosacàrid catalitzat per la glicosiltransferasa OLED (família GT1) del microorganisme Streptomyces antibioticus Per a això, abans ha calgut modelitzar una conformació catalíticament activa de l’enzim. Els càlculs realitzats en aquesta tesi s’han basat en simulacions de dinàmica molecular, anàlisi de modes normals i en mètodes QM / MM. En l’últim capítol, es presenta el desenvolupament d’un nou protocol metodològic per a l’obtenció de barreres d’energia de Gibbs de les etapes del mecanisme catalític, un protocol que té en compte les fluctuacions del complex de Michaelis proteïna-substrat corresponents a l’anomenat desordre instantani que presenten els sistemes complexos.| Data del Ajut | 2 de febr. 2022 |
|---|---|
| Idioma original | Espanyol |
| Supervisor | M. Dels Angels Gonzalez Lafont (Director/a) & Laura Masgrau Fontanet (Codirector/a) |
Com citar-ho
- Standard
- Short
- Compact