Crystal Structure of Two Anti-Porphyrin Antibodies with Peroxidase Activity

Reportem les estructures cristal·lines a una resolució de 2,05 i 2,45 Å de dos anticossos, el 13G10 i el 14H7, dirigits contra un ferro(III)-a-a-b-carboxifenilporfirina que mostren certa activitat peroxidasa. Tot i que aquests dos anticossos difereixen en només un aminoàcid a la seva cadena λ variable i mostren una identitat de seqüència del 86% a la seva cadena pesada variable, les seves regions determinants complementàries (CDR) CDRH1 i CDRH3 adopten conformacions molt diferents. La presència dels residus Met o Leu en posicions anteriors al residu H101 a la CDRH3 del 13G10 i el 14H7, respectivament, donen lloc a butxaques de combinació poc profundes amb formes diferents que són majoritàriament hidròfobes. L'haptè i altres derivats carboxifenil-derivatitzats d'iron(III)-porfirina s'han modelat en els llocs actius dels dos anticossos usant l'acoblament del lligand de proteïnes amb el programa GOLD. L'haptè es manté a les butxaques dels anticossos 13G10 i 14H7 per una xarxa forta d'enllaços d'hidrogen amb dues o tres carboxilats dels substituents carboxifenils de la porfirina, respectivament, així com nombroses interaccions d'apilament i van der Waals amb el CDRH3 molt hidròfob. Tot i això, no s'ha trobat cap residu aminoàcid que chelate l'ió ferro. El modelatge també ens permet racionalitzar el reconeixement de cofactors porfirínics alternatius pels anticossos 13G10/porfirina i l'efecte d'unió a l'imidazol en l'activitat peroxidasa dels complexos 13G10/porfirina. © 2012 Muñoz Robles et al.