Proteinas transportadoras de menbrana: Estructura y función

En aquest projecte es planteja l'estudi de tres sistemes de transport de membrana: la bateriorrodopsina principalment, la permeasa de melibiosa i el translocador ADP/ATP. L'estudi del mecanisme molecular del transport de protons per la bacteriorrodopsina es projecta mitjançant el disseny i obtenció de mutants i el seu análisi per métodes espectrosópics, especialment FTIR. Seguirem diverses estratègies: en primer lloc, s'analitzaran els fenòmens de transferència de protons que tenen lloc en la regió extracelular. L'objectiu és determinar quins grups són receptors i donants del protó, y com es transmeten les senyals entre Asp85 i el grup expulsor del protó al mitjà: Quin es el paper de Arg82 i de la red de molècules d'aigua?. En segon lloc, s'estudiaran els canvis en el costat extracelular. Altre aspecte a estudiar és el mecanisme de tranferència del protó en el costat citoplasmàtic, amb l¡'objectiu de determinar com es produeix el salt del protó a través de distàncies de 10-12 A on aparentment no existeixen grups protonables. Finalment, s'estudiarà mitjançant diverses tècniques (FTIR, EXAFS,AFM) l'anàlisi de la unió de cations, amb la finalitat d'obtenir noves dades de la situació i la seva funció. L'estudi de la permeasa de melibiosa i del translocador ADP/ATP segueix una mateixa finalitat: determinar els canvis estructurals y/o de protonació que tenen lloc al unir els substractes. Per això s'aplicaran diverses tecniques de FTIR: espectres de diferència; cinètica de intercanvi H/D; canvis de orientació de les hèlixs.