Predicció d'estructura de proteïnes: (I) Conformació de llaços en modelatge per homologia i (II) Ancoratge proteïna/proteïna

L'objectiu principal del projecte consisteix a millorar la precisió de la predicció de l'estructura de proteïnes en el modelat per homologia. També, a consolidar la relació científica que hem establert amb el grup de Londres que de moment ha resultat molt productiva. La nostra present col·laboració, subvencionada per Accions Integrades, ha dut a la classificació automàtica de la conformació de llaços de proteïnes (article enviat a J. Mol. Biol.) Les pròximes etapes són (1) usar aquesta informació en la millora de la precisió del modelat per homologia i (2) estendre la classificació al cas concret de la combinació de llaços de proteina dels anticossos, ajudant així en aquest àrea del modelat. Un projecte subsidiari, (3), consistiria a aplicar un recentment desenvolupat algoritme per al modelat de la punta entre proteïnes a diversos sistemes del tipus proteasa/inhibidor, estudiats experimentalment en el grup de Barcelona.