Estudis dels mecanismes de regulació mitjançant fosforil·lació de proteïnes en llevat

La fosforilació reversible de proteïnes és un dels mecanismes de modificació de proteïnes que juguen un paper crític i totes les formes de vida en regular importants i diverses funcions cel·lulars. Les proteïnes quinases (PQ) i fosfatases (PF) són, respectivament, els enzims responsables de la fosforilació i desfosforilació dels substrats, modificant les seves activitats enzimàtiques, localització cel·lular o molècules a què s'uneixen. El desxiframent de les genomes de diversos organismes eucariotas ha posat de manifest que més del 2% dels mateixos estan dedicats a gens que codifiquen PQ i PF. Ha evidenciat, així mateix, que estem lluny encara en cas d'entendre per complet les complexes vies de senyalització que tenen lloc a la cèl·lula. És per això que es fa evident la necessitat d'aplicar noves estratègies per a un més ràpid avenç en aquest camp. Plantejo l'ús de la combinació de les poderoses tecnologies de genòmica i proteòmica en conjunció amb tècniques de genètica i bioquímica per estudiar els esdeveniments de senyalització intracel·lular a través de la fosforilació de proteïnes utilitzat el llevat S. cerevisiae com a model. Mitjançant microarrays de DNA s'identificaran els patrons d'expressió en resposta a l'eliminació de certes PQ i PF no essencials, tant en condicions estàndard com a subjectes a un plafó de diferents situacions d'estrès. L'agrupació de les proteïnes en funció de la similitud dels perfils d'expressió que les seves absències provoquen ens permetran assignar noves o addicionals funcions cel·lulars a les PQ i a PF estudiades. A més, s'utilitzaran diferents tècniques de proteòmica tant per identificar nous mecanismes reguladors de PQ i PP com per a la recerca de substrats de les mateixes a escala global