Empremta de la selecció, desequilibri de lligament i mapatge ultrafí en l'espècie porcina

Si identifiquem una regió de la genoma que hagi estat diana de la selecció, aquesta regió hauria de contenir gens d'interès econòmic potencial. L'objectiu d'aquest projecte és poder distingir si els canvis en freqüències alèlicas de diverses poblacions de porcí a cinc gens candidats són degudes atzar, a la selecció, o a ambdues. Per a això, analitzarem el polimorfisme nucleotídico (SNPs) a cinc regions de la genoma del senglar i dues poblacions porcines: porc Ibèric i la raça Duroc. Les regions a analitzar són: IGF2 (cr.2), SLA (cr.7), DECR (cr4), SRY (cr.Y), FACL4 (cr.X). La comparació entre les línies Ibèriques i el senglar ens permetrà descobrir alguns dels canvis produïts en la domesticació, mentre que la comparació amb Duroc ens informaria sobre el tipus de selecció que ha ocorregut a cada una de les regions analitzades. Aquest estudi ens permetrà caracteritzar, a més, una sèrie de paràmetres fonamentals per a la cartografia fina de QTL, com són la taxa de mutació i de desequilibri de lligament a les diferents regions. Com a complement el treball experimental, també proposem desenvolupar: 1) diverses innovacions metodològiques per identificar els polimorfismes causals (mapatge ultrafí) i per relacionar les dades d'expressió amb els polimorfismes d'ADN (Genètica genòmica); i 2) una plataforma bioinformàtica accessible públicament via Web que permeti facilitar al màxim la gestió de les nostres dades i extreure automàticament, a partir de les bases públiques genètiques (GenBank, etc..) la informació rellevant de polimorfismes en porcí