Descripció
The data provided corresponds to the molecular dynamics simulations performed for the wild-type (WT) and E220A mutant of HvoExoI glycosyl hydrolase in covalent complex with glucose (reaction intermediate) and with laminaripentaose bound. The data was used to study the effect of the mutation and how this area affects the correct positioning of the catalytic water and, thus, catalysis.
Three repicates of 1 microsecond each were performed for each system using the AMBER program.
For each replicate (r0, r1 and r2), around 10,000 PDB files of the enzyme:substrate complexes are provided.
| Data disponible | 9 d’abr. 2025 |
|---|---|
| Editor | CORA.Repositori de Dades de Recerca |
-
MODELIZACION E INGENIERIA COMPUTACIONAL DE ENZIMAS PARA LA DEGRADACION Y VALORIZACION DE LA BIOMASA
Masgrau Fontanet, L. (Investigador/a principal) & Fernandez Luengo Flores, X. (Col.laborador/a)
Fons Europeu de Desenvolupament Regional (FEDER)
1/09/22 → 31/08/26
Projecte: Projectes i Ajuts a la Recerca
-
Projecte: Ingeniería computacional de enzimas que sintetizan e hidrolizan carbohidratos
Masgrau Fontanet, L. (Investigador/a principal)
1/07/23 → 31/12/25
Projecte: Projectes i Ajuts a la Recerca
-
Estudios y desarrollos computacionales en química glicobiológica
Masgrau Fontanet, L. (Investigador/a principal) & Fernandez Luengo Flores, X. (Col.laborador/a)
Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN), Fons Europeu de Desenvolupament Regional (FEDER)
1/01/19 → 30/09/22
Projecte: Projectes i Ajuts a la Recerca
Producció científica
- 1 Article
-
The structure and dynamics of water molecule networks underlie catalytic efficiency in a glycoside exo-hydrolase
Masgrau Fontanet, L., 10 de maig 2025, In: Communications Biology. 8, 17 pàg., 729.Producció científica: Contribució a revista › Article › Recerca › Avaluat per experts
Accés Obert4 L'enllaç s'obre en una pestanya nova Cites (Scopus)
Com citar-ho
- DataSetCite
- Short
- Compact